Сравнительно быстрая и простая процедура, во время которой уменьшается размер желудка и «новый» желудок соединяется с тонким кишечником. Пациент худеет и потому, что из-за сокращения емкости желудка больше не может съесть привычное количество еды, и потому, что уменьшается площадь всасывания питательных веществ. Место, где начинается всасывание питательных веществ и калорий из-за измененного соединения кишечника находится примерно на 2 метра дальше, чем обычно. После операции остальная часть желудка остается в организме и продолжает синтезировать пищеварительные ферменты, несмотря на то, что пища в нее больше не попадает.

Единственное отличие этой операции от широко применяемого традиционного шунтирования желудка заключается в том, что создается только один анастомоз, то есть пищеварительный тракт делится и соединяется только в одном месте, поэтому операция занимает меньше времени. С точки зрения эффективности оба подхода одинаково эффективны для избавления от лишнего веса. Мини-шунтирование желудка по необходимости является обратимой операцией.